Virus Shamonda : un premier cas humain en France, les investigations se poursuivent

La détection du virus Shamonda chez un patient pris en charge aux Hospices Civils de Lyon fait l’objet d’investigations associant santé humaine, animale et environnementale. Dans son point publié le 23 octobre, Santé publique France décrit un premier cas humain survenu dans un contexte d’immunodépression profonde, sans élément suggérant à ce stade une transmission entre personnes.

Les autorités sanitaires ont été informées de l’infection le 7 octobre. Le patient présentait une atteinte neurologique grave et est décédé début octobre. La présence du virus dans plusieurs prélèvements biologiques a confirmé l’infection, mais ne suffit pas à établir son rôle dans le décès.

Une infection confirmée, un rôle dans le décès encore étudié

L’ECDC, dans une information publiée le 22 octobre, précise que les investigations portent sur la question de savoir si Shamonda a causé le décès ou y a contribué, ainsi que sur les circonstances de la contamination. Il distingue la situation de ce patient, traité pour une maladie grave le rendant particulièrement vulnérable, de celle de la population générale.

Santé publique France indique qu’en l’état des connaissances disponibles à la date de son point, aucun élément ne suggère une transmission interhumaine ni un risque sanitaire pour la population générale. Cette appréciation reste liée aux données disponibles ; les investigations se poursuivent pour mieux caractériser les risques potentiels.

La piqûre d’un moucheron est une hypothèse

Le virus Shamonda appartient au genre Orthobunyavirus et était jusqu’alors connu chez l’animal. Sa circulation entre animaux implique des moucherons piqueurs du genre Culicoides.

Pour le cas humain, la piqûre d’un moucheron infecté constitue l’hypothèse privilégiée au regard des informations recueillies auprès de l’entourage du malade. Elle n’est pas présentée comme une voie de contamination définitivement démontrée. D’autres sources possibles restent étudiées, notamment à travers l’environnement du patient, ses déplacements et ses expositions éventuelles.

La surveillance animale ne correspond pas à des cas humains

Le point français signale qu’au 20 octobre, le virus avait été détecté chez des bovins dans 52 départements hexagonaux, chez des ovins dans l’Oise et l’Aveyron, et chez un cheval dans l’Hérault. Ces données concernent les animaux : elles ne désignent ni 52 cas humains ni 52 départements avec des infections humaines.

Les travaux associent notamment les laboratoires de référence de l’Anses et des arbovirus, l’École nationale vétérinaire de Toulouse et les Hospices Civils de Lyon. Ils comprennent le séquençage du virus détecté chez le patient, la comparaison avec les souches animales et l’étude des insectes collectés pendant la saison. L’objectif est de comprendre cette première détection et de repérer une éventuelle évolution de la situation.